L'encoder magnetico include principalmente un magnete e un PCB in grado di leggere i poli magnetici N e S. E poi le parti sensibili potrebbero dire le informazioni sulla posizione rotazionale sotto forma di uscita del segnale. L'encoder magnetico ha i vantaggi di anti-shock, prestazioni affidabili, costruzione semplice. L'encoder magnetico incrementale ha un costo inferiore rispetto all'encoder ottico. La risoluzione dell'encoder ottico dipende dalle linee sul disco di vetro. Il disco più grande, più linee, la risoluzione più alta. L'encoder incrementale magnetico può essere in alta risoluzione con dimensioni ridotte.